MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 chromosome

Total Repeats: 5511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016805	CTT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016805	GTC	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016805	TCATT	2	10	75	84	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016805	GA	3	6	105	110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016805	GT	3	6	1486	1491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016805	AAC	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016805	GTT	2	6	1551	1556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016805	TTA	3	9	1594	1602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016805	CTA	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016805	T	6	6	1613	1618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016805	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016805	AAACA	2	10	2869	2878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016805	TA	3	6	2902	2907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016805	TGA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016805	ATAG	2	8	4593	4600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016805	GT	3	6	6642	6647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016805	GAG	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016805	A	6	6	9259	9264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016805	TAG	2	6	9281	9286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016805	T	7	7	9299	9305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016805	AAC	2	6	9351	9356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016805	AGT	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016805	TAA	2	6	11423	11428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016805	TAAA	2	8	11441	11448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016805	AAAT	2	8	11479	11486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016805	TAAT	2	8	11533	11540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016805	CTG	2	6	11628	11633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016805	ATT	2	6	11655	11660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016805	TTAT	2	8	18876	18883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016805	CAA	2	6	18887	18892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016805	T	7	7	22186	22192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016805	A	6	6	22201	22206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016805	A	8	8	22285	22292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016805	A	7	7	22298	22304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016805	G	6	6	22316	22321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016805	AGCGA	2	10	22356	22365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016805	G	6	6	22386	22391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016805	AGC	3	9	22392	22400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016805	CGA	2	6	22417	22422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016805	CTT	2	6	22426	22431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016805	AGT	2	6	22438	22443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016805	ATA	2	6	22470	22475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016805	AACAAA	2	12	22558	22569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016805	AACA	2	8	22588	22595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016805	GGC	2	6	22703	22708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016805	AGTG	2	8	22761	22768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016805	TTAG	2	8	22916	22923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016805	TGG	2	6	22925	22930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016805	ATG	2	6	22951	22956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016805	GA	3	6	22969	22974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016805	CGC	2	6	23070	23075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016805	GT	3	6	23076	23081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016805	TGT	2	6	23109	23114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016805	GAA	2	6	23119	23124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016805	TACCA	2	10	23158	23167	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016805	CAG	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016805	AGCG	2	8	23246	23253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016805	TTA	2	6	23262	23267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016805	AT	3	6	23376	23381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016805	GAA	2	6	23383	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016805	GGC	2	6	23402	23407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016805	AGG	2	6	23507	23512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016805	GAA	2	6	23646	23651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016805	GGT	2	6	23721	23726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016805	GTC	3	9	23732	23740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016805	TCGTG	2	10	23744	23753	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016805	GGA	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016805	GAC	2	6	23860	23865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016805	ATC	2	6	23871	23876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016805	AC	3	6	23898	23903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016805	CGC	2	6	24037	24042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016805	AC	3	6	24067	24072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016805	AGGA	2	8	24127	24134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016805	CCT	2	6	24209	24214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016805	TTTG	2	8	24256	24263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016805	TGT	2	6	24425	24430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016805	ACA	2	6	24501	24506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016805	GTTAA	2	10	24593	24602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016805	GTG	2	6	24612	24617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016805	ACTA	2	8	24652	24659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016805	AGC	2	6	24795	24800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016805	AGAA	2	8	24807	24814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016805	GCG	2	6	24833	24838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016805	AT	3	6	24894	24899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016805	ACG	2	6	25148	25153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016805	AAG	2	6	25159	25164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016805	A	6	6	25380	25385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016805	TC	3	6	25443	25448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016805	AT	3	6	25642	25647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016805	AGC	2	6	25701	25706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016805	CGA	2	6	25832	25837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016805	CTG	2	6	25854	25859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016805	TTA	2	6	26041	26046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016805	AGG	2	6	26062	26067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016805	GTGC	2	8	26093	26100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016805	T	6	6	26131	26136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016805	GA	3	6	26280	26285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016805	CGG	2	6	26508	26513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016805	TGC	2	6	26708	26713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016805	TAGG	2	8	26724	26731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016805	AGA	2	6	26738	26743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016805	CTAGT	2	10	26751	26760	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016805	TAC	2	6	26779	26784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016805	CCT	2	6	26867	26872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016805	AAGC	2	8	26942	26949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016805	GGT	2	6	27003	27008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016805	CGT	2	6	27198	27203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016805	GAG	2	6	27247	27252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016805	GTT	2	6	27301	27306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016805	TATG	2	8	27331	27338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016805	GAGAT	2	10	27382	27391	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016805	GAT	2	6	27426	27431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016805	AGA	3	9	27558	27566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016805	GTGTC	2	10	27605	27614	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016805	AC	3	6	27628	27633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016805	AGT	2	6	27678	27683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016805	GGA	2	6	27685	27690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016805	AG	3	6	27741	27746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016805	CAT	2	6	27852	27857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016805	AGT	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016805	TGG	2	6	28088	28093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016805	AT	3	6	28212	28217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016805	AGG	2	6	28259	28264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016805	T	7	7	28316	28322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016805	GATT	2	8	28432	28439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016805	AGAC	2	8	28454	28461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016805	C	6	6	28522	28527	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_016805	AAGA	2	8	28635	28642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016805	GAA	2	6	28746	28751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016805	ATA	2	6	28758	28763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016805	TCG	2	6	28792	28797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016805	GCCT	2	8	28870	28877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016805	CGG	2	6	28985	28990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016805	AAG	2	6	29217	29222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016805	T	7	7	29243	29249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016805	TTC	2	6	29274	29279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016805	A	6	6	29286	29291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016805	AAT	2	6	29298	29303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016805	GAAA	2	8	29318	29325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016805	TAA	2	6	29355	29360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016805	TA	3	6	29395	29400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016805	A	7	7	29409	29415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016805	ATT	2	6	29470	29475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016805	CG	3	6	29486	29491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016805	TAT	2	6	31669	31674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016805	AAC	2	6	31699	31704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016805	TC	3	6	31718	31723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016805	TAAAA	2	10	31739	31748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016805	TAAA	2	8	41928	41935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_016805	AT	3	6	137548	137553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_016805	TAA	2	6	137558	137563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_016805	A	6	6	139623	139628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_016805	T	6	6	139649	139654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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